Bộ phim kể về Kurenai Wataru, một cậu thanh niên nhút nhát, rụt rè, bị dị ứng với thế giới. Cậu sống một mình trong căn nhà của cha cậu, Kurenai Otoya để lại. Tuy nhiên, cậu là người được định mệnh lựa chọn trở thành Kamen Rider Kiva, chiến đấu chống lại những quái vật có tên gọi Fangire. Thế nhưng không phải chỉ có mình cậu chống lại Fangire, một tổ chức mang tên Aozora cũng tìm kiếm và tiêu diệt những con quái vật ấy bằng một Rider mang tên Kamen Rider IXA, một Rider đem lòng thù hận với Kiva. Câu chuyện được kể song song giữa hai mốc thời gian là 1986 và 2008. Trong quá khứ, cha của Wataru, Kurenai Otoya là một thành viên của Aozora và cũng chiến đấu chống lại các Fangire.